| dc.description.abstract | Resirkulering akvakultur systemer (RAS) teknologi for ferskvannsproduksjon av smolt ble for første gang brukt med marint vann for post-smolt påvekst, dvs. påvekst 100-500 gram i tre måneder. Mikrobiell dypsekvensering av produksjonsvann, fiskehud og biofilmer på biofilter og fisketankvegger ble utført gjennom fire produksjonssykluser (2-5), for å få innsikt i økologiske, patologiske og driftsmessige problemer, og som et første skritt for å utvikle et erfaringsbasert overvåkningsprogram for RAS. I tillegg ble et kommersielle inokulum som var brukt til kolonisering av biofilteret evaluert separat. Mikrobene fra inokulumet dominerte biofilmen i biofilteret frem til den femte produksjonssyklusen, og overflaten til biofilmbærerene ble kolonisert i samsvar med det som er tidligere rapportert for bruk av marint kystvann for overflatekolonisering. Imidlertid var modningstiden lang for steg to av den bakterielle nitrifikasjonsprosessen i biofilteret, og Nitrospira etablerte seg omtrent 15 måneder etter oppstart. Stabilisering av biofilmmatriksen av Myxococccales medlemmer kombinert med en saltholdighetsreduksjon i RAS-vannet til 22‰, bidro til at nitrifikasjonen kom i gang. Trolig var etableringen av Myxococcales og også Vibrio medlemmer i biofilmen forsinket av spesifikk predasjon, ixotrofi, utført av to første-kolonister fra Bacteroidetes. De ixotrofe stammene forsvant fra biofilmen da antibiotika ble gitt til fisken for å hindre hudsår (Produksjonssyklus 2) og når biofilmen ble behandlet direkte med hypokloritt / flytende ozon før neste syklus. Dominansen av Myxococcales i biofilterbiofilmen under den tredje produksjonssyklus forårsaket de største skiftene i de mikrobielle samfunnsstrukturene gjennom RASet i forsøksperioden. De fleste biofilmbakteriene ble redusert fire ganger av lysisaktiviteten til Myxococcales, og dessuten var det et skifte i produksjonsvannet fra Colwellia til en ikke-patogen Francisella-stamme, noe som indikerte at nekromasse var tilgjengelig i vannet. Saltholdigheten var høy i løpet av denne syklusen, og forhindret sannsynligvis at Nitrospira utnyttet den åpne biofilmoverflaten og de biofilmforsterkende egenskapene til Myxoococcales til å etablere seg på dette tidspunktet. Mindre intense ekstinksjons- og adhesjonsprosesser foregikk kontinuerlig i biofilteret, og et modnet biofilter ble ikke oppnådd i løpet av den eksperimentelle tidsperioden. Taxa inn og ut av biofilmen var i stor grad de samme. RAS-hendelser assosiert med reduksjon i biofilm taxa i biofilteret var skarpe pH /saltholdighetsfall, endring i oljekomponenter i fiskefôret og dominans av Myxococcales, mens antibiotikabehandling av fisken, behandling av biofilteret med oksiderende kjemikalier og re-inokulering økte antall taxa i biofilteret. Sistnevnte åpnet også for adhesjon av opportunistiske bakterier. Taxa som bare ble oppdaget i vannet eller biofilteret en gang, stammet hovedsakelig fra miljøet. Biofilmen i biofilteret og produksjonsvann var i motsatte diversitets faser, og vi tolker dette som at mikrober i vann i større grad enn mikrober i biofilm påvirkes av miljøendringer som skjer raskere enn mikrobiell adaptasjon i et RAS. Vi anbefaler bruk av mikrobiell dypsekvensering for RAS-overvåking og har forslag til videreutvikling av tilnærmingen. | en_US |
