BORA - UiBBORA
    • English
    • norsk
  • English 
    • English
    • norsk
  • Login
View Item 
  •   BORA Home
  • Faculty of Mathematics and Natural Sciences
  • Department of Biology
  • Department of Biology
  • View Item
  •   BORA Home
  • Faculty of Mathematics and Natural Sciences
  • Department of Biology
  • Department of Biology
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Utvikling og testing av RNA-probe mot nsP2 (Salmonid alfavirus subtype 2) for bruk på celler og vev

Type
Master thesis
Thumbnail
View/Open
58505271.pdf (2.839Mb)
Date
2009-06-15
Author
Berg, Ellen Sandvik
Share

Metadata
Show full item record
Abstract
Salmonid alfavirus (SAV) er et virus i familien Togaviridae og forårsaker sykdomsproblemer ved oppdrett av laks (Salmo salar L) og regnbueørret (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) i Europa. Det er per i dag kjent at det forekommer tre ulike subtyper, SAV 1 -3, og det er gjort studier som indikerer at det finnes tre subtyper til. SAV 1 er i all hovedsak utbredt i Storbritannia og gir sykdom hos både laks og regnbueørret, mens SAV 2 i all hovedsak er kjent for å føre til sykdom hos regnbueørret i ferskvann i Frankrike. I Norge har SAV 3 størst utbredelse på Vestlandet, hovedsakelig fylkene Hordaland og Sogn og Fjordane, men i de senere år har dette området utvidet seg noe og utbrudd har også forekomet i Nord Norge. Introduksjonsvei, målceller og målorgan for SAV er emner som det foreligger svært lite eller ingen kunnskap om. For å belyse dette tema har det i denne oppgaven blitt utviklet en digoxigenin-merket RNA probe for påvisning av SAV-spesifikt RNA ved in situ RNA-RNA hybridisering. Proben har vist seg å være et meget vellykket verktøy for påvisning av SAV i cellekultur og den har trolig stort potensial for påvisning av SAV også fra vevssnitt eller fra vev ved whole mount in situ hybridisering (ISH). Det var også planlagt å teste ut proben ved whole mount ISH på plommesekkyngel av laks og det ble i den forbindelse utført smiteforsøk med SAV 2 og SAV 3. Uforutsette problemer med smitte førte imidlertid til at dette ikke var mulig å gjennomføre, men det ble vist at 0,5 grams lakseyngel kan i.p. smittes med SAV 3. Det var også mulig å påvise SAV fra badsmittet 0,5 grams yngel, men resultatene indikerte at tilstedeværelsen av virus i yngelen var lav. Det er også spekulert i hvorvidt yngelen kunne ha vært infisert med viruset før smitteforsøkene ble iverksatt da det ble funnet SAV-positiv yngel fra kontrollgruppen. Det er imidlertid ikke mulig å dra noen slutninger ut i fra dette på grunn av lavt antall yngel analysert og lave mengder SAV-spesifikt RNA til stede i den positive yngelen.
URI
http://hdl.handle.net/1956/3513
Publisher
The University of Bergen
Subject
SAVSalmonid alphavirusRNA-probeIn situHybridisering
Collections
  • Department of Biology 743
Copyright the author. All rights reserved
The author

University of Bergen Library
Contact Us | Send Feedback
 

 

Browse

All of BORACommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsTypeThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsType

My Account

LoginRegister

Statistics

View Usage Statistics

University of Bergen Library
Contact Us | Send Feedback