dc.contributor.author | Reikvam, Aslak | |
dc.date.accessioned | 2021-06-25T00:19:28Z | |
dc.date.available | 2021-06-25T00:19:28Z | |
dc.date.issued | 2021-06-01 | |
dc.date.submitted | 2021-06-24T22:00:36Z | |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/11250/2761244 | |
dc.description.abstract | Proteinene CD4-1 og CD8-alfa er essensielle ko-reseptorer på T-celler, og nyttige markører for å identifisere bestemte sub-populasjoner av celler i immunforsvaret. Målet med denne oppgaven var å karakterisere disse molekylene hos berggylt (Labrus bergylta) og undersøke genenes uttrykkingsmønster i ulike vev. Potensielle sekvenser for CD4-1 og CD8-alfa ble identifisert i to ulike regioner av berggylt-genomet. Nabogenene deres korresponderte med nabogenene som er funnet hos andre teleoster. Ekson/intron-strukturen til genene tilsvarte organiseringen som er beskrevet i andre arter. På basis av sekvensinformasjonen i databasen (GenBank) ble det designet primere for PCR-amplifikasjon av cDNA for CD4-1 og CD8-alfa fra berggylt. PCR-produktene ble klonet i plasmidvektor og sekvensert. De translaterte polypeptid-sekvensene reflekterte slektskapet til andre teleoster, og aminosyrene som er viktige for dannelsen av de strukturelle domenene i molekylene var konservert. Predikerte 3D-strukturer og glykosyleringsseter var i overensstemmelse med de karakteristiske trekkene for målproteinene. Den ekstracellulære delen av CD4-1 bestod av 4 Ig-domener, mens CD8-alfa hadde ett Ig-domene og en lengre og sterkt glykosylert hengselregion. Det ble tatt organpakker fra 3 oppdrettete berggylter og tymus-prøver fra 10 fisker. Både CD4-1 og CD8-alfa var sterkt uttrykt i tymus. Siden organet er lite iøynefallende hos berggylt var det vanskelig å få rene tymus-prøver. Mengden av CD4-1 og CD8-alfa mRNA i tymus-prøvene viste derfor også hvor vellykket prøvetakingen var. Blodrike organer som milt, hodenyre og gjeller hadde en relativt høy uttrykking i forhold til muskel og lever. I nyreprøvene var det mer CD4-1 enn CD8-alfa mRNA, mens forholdet var motsatt i tymus. Variasjonen i uttrykkingen var imidlertid stor mellom fiskene. For å kunne vurdere resultatene bedre ble andre cellemarkører (CD3e, RAG1 og RAG2) inkludert i RT-qPCR-analysene. Uttrykkingsnivåene til disse cellemarkørene korresponderte godt med CD4-1- og CD8-alfa-resultatene. Karakteriseringen av T-cellemarkørene CD4-1 og CD8-alfa har lagt forholdene til rette for at man nå kan identifisere sentrale populasjoner av immunceller hos berggylt og måle immunresponser hos denne arten i mer detalj. | |
dc.language.iso | nob | |
dc.publisher | The University of Bergen | |
dc.rights | Copyright the Author. All rights reserved | |
dc.subject | T-celle | |
dc.subject | berggylt | |
dc.subject | uttrykking | |
dc.subject | CD4 | |
dc.subject | rensefisk | |
dc.subject | Labrus bergylta | |
dc.subject | CD8 | |
dc.title | Molekylær karakterisering og analyse av uttrykkingsmønsteret til T-cellemarkørene CD4-1 og CD8-alfa i berggylt (Labrus bergylta) | |
dc.title.alternative | Molecular characterization and analysis of the expression pattern of T-cell markers CD4-1 and CD8-alfa in ballan wrasse (Labrus bergylta) | |
dc.type | Master thesis | |
dc.date.updated | 2021-06-24T22:00:36Z | |
dc.rights.holder | Copyright the Author. All rights reserved | |
dc.description.degree | Masteroppgave i fiskehelse | |
dc.description.localcode | FISK399 | |
dc.description.localcode | MAMN-FISK | |
dc.subject.nus | 759906 | |
fs.subjectcode | FISK399 | |
fs.unitcode | 12-60-0 | |